Dans un monde magique au beau milieu du pays de Fiore, la jeune Lucy Heartfiria a pour but de rejoindre la guilde magique Fairy Tail. Arrivée dans une petite ville côtière, elle entend parler d'un fameux sorcier surnommé Salamander, de Fairy Tail. Lucy décide donc de le rencontrer en personne. Sur le chemin, elle fait la rencontre de Natsu Dragneel, qui la sauve plus tard de Bora, de Providence, le vil imposteur qui se fait appeler Salamander. Lucy remercie Natsu de l'avoir sauvée, et ce dernier la surprend en l'invitant à rejoindre sa guilde, qui n'est autre que Fairy Tail… Un monde de magie et d'aventures s'ouvre alors devant nos héros !

Shingo Uryû, élève au lycée Kagamidai, a été choisi, ainsi que sa sœur Sakuno et son ami Hayato, pour faire partie d'un groupe d'étudiants qui suivra un cursus scolaire un peu particulier : pendant les dix mois suivants, ce groupe sera inséré dans une classe-test à l'intérieur du lycée Yûhimeijo, jusqu'alors uniquement pour filles, dans le but d'expérimenter une future mixité de l'établissement. Quelle n'est pas alors la surprise de Shingo quand il découvre que la fille du directeur n'est autre que Airi Sena, la jolie demoiselle qui l'a aidé à retrouver sa sœur le soir précédent, mais qu'en plus elle lui annonce son refus catégorique d'accepter toute présence masculine et sa volonté de conserver cette école traditionnelle telle quelle !

Yûgi muto est un jeune lycéen qui se fait continuellement embêter par les autres élèves de son école. Un jour, il reçoit de son grand-père un objet trouvé lors d'une fouille en Égypte : le puzzle du Millénium. Nul n'était auparavant parvenu à reconstituer cet objet antique, mais le jeune Yûgi réussit finalement à l'assembler.

À cet instant est libéré l'esprit d'un ancien pharaon d'Égypte, enfermé jusqu'alors dans le puzzle, qui viendra habiter le corps de Yûgi. C'est un être sûr de lui et ne reculant jamais devant rien. Cependant, peu de gens sont au courant de la vérité. Le pharaon est spécialiste de tous les types de jeu. Il est d'ailleurs le maître du jeu des ténèbres. Mais pour une raison inconnue, il ne se souvient pas de son passé ni qui il est exactement.

L’histoire commence à la toute fin du XIX^e siècle, à La Porte, dans l’Indiana aux États-Unis, dans un orphelinat situé non loin du lac Michigan. L’établissement est tenu par une vieille demoiselle, Miss Pony et une jeune religieuse, Sœur Lane. Un jour, deux bébés abandonnés sont découverts : Candy et Annie. Les deux enfants grandissent et deviennent inséparables. Plusieurs années (6 dans le manga et 10 dans l’animé) passent et Annie est adoptée par la famille Brighton. Annie, dont les parents ne veulent pas que l’on sache qu’elle vient d’un orphelinat, envoie une lettre d’adieux à Candy. Cette dernière se retrouve à pleurer sous l’arbre d’une colline surplombant la Maison Pony. Là, au son d’une cornemuse, apparaît celui qu’elle surnommera « Le prince des collines ».

Haruka, Kana et Chiaki sont trois sœurs vivant seules dans un appartement. Haruka, l’aînée de la famille s’occupe en grande partie des tâches de la maison, ce qui explique le profond respect qu’éprouve Chiaki (la plus jeune) envers elle, la prenant ainsi comme exemple à suivre. Respect qu’elle ne redirige pas vers sa deuxième grande sœur Kana dont le caractère est à l’opposé de celui d’Haruka. En effet, à la fois dynamique et paresseuse, cette dernière préfère passer son temps à s’amuser plutôt qu’à étudier. Avec son tempérament de feu et son énergie inépuisable, Kana apporte toujours de l’animation dans la maison. Ceci est d’autant plus vrai lorsqu’elle reçoit dans son casier une lettre d’amour de la part d’un de ses camarades de classe. Quiproquos et gags s’enchaînent alors rendant la vie de ses trois sœurs toujours plus délirante et euphorisante.